結(jié)核病是危害人類健康的主要傳染病之一，是當(dāng)今世界上傳染病中的主要?dú)⑹?/SPAN>，我國(guó)結(jié)核病疫情日趨嚴(yán)重，防控形勢(shì)非常嚴(yán)峻。目前用于預(yù)防結(jié)核病的卡介苗對(duì)成年人的肺結(jié)核幾乎沒(méi)有保護(hù)力，近年來(lái)全球正在研發(fā)疫苗，如結(jié)核減毒活疫苗、BCG重組疫苗、結(jié)核亞單位疫苗以及DNA疫苗等臨床試驗(yàn)效果均不理想。目前，母牛分枝桿菌（Mycobacterium vaccae）疫苗是近90年來(lái)針對(duì)結(jié)核病僅有的一個(gè)進(jìn)入III期臨床試驗(yàn)的免疫治療性疫苗，其商品名稱為微卡。盡管其應(yīng)用前景非常看好，但是關(guān)于此疫苗株的基因組、蛋白質(zhì)組、免疫抗原組份等背景都不清楚。

金奇課題組的鄭建華副研究員等采用第二代深度測(cè)序（next-generation sequencing (NGS) technologies）結(jié)合第三代測(cè)序技術(shù), 對(duì)微卡的全基因組序列進(jìn)行了測(cè)定，同時(shí)利用凝膠電泳結(jié)合高分辨率、高精確性的傅里葉轉(zhuǎn)換質(zhì)譜，對(duì)微卡的蛋白質(zhì)組進(jìn)行了系統(tǒng)、全面的分析，鑒定出3387個(gè)可信度極高的蛋白，其中581個(gè)基因組中編碼的“hypothetical proteins” 在蛋白水平得到了驗(yàn)證。同時(shí)確認(rèn)了445個(gè)蛋白的翻譯起始位點(diǎn)，更正了98個(gè)蛋白的起始位點(diǎn)。更有意思的是，首次發(fā)現(xiàn)了38個(gè)在基因組注釋中漏掉的“新”蛋白。結(jié)合蛋白質(zhì)組和基因組測(cè)序結(jié)果，采用蛋白組基因組學(xué)方法，首次獲得微卡的基因組精細(xì)圖譜和準(zhǔn)確的注釋。

隨后采用免疫蛋白質(zhì)組學(xué)方法，利用活動(dòng)性肺結(jié)核病人的血清樣本，初步篩選并鑒定出35個(gè)免疫抗原候選物，將其中的20個(gè)編碼基因進(jìn)行克隆和表達(dá)，純化后的蛋白與100個(gè)結(jié)核病人的血清樣本進(jìn)行體液免疫驗(yàn)證，其中的8個(gè)能產(chǎn)生較強(qiáng)的陽(yáng)性免疫反應(yīng)。進(jìn)一步進(jìn)行細(xì)胞免疫分析后發(fā)現(xiàn)，其中的一個(gè)蛋白，MYVA_1927，也具有較強(qiáng)的細(xì)胞免疫活性。這是首次從體液免疫和細(xì)胞免疫水平鑒定出微卡的多個(gè)免疫原，有利于進(jìn)一步深入地闡明微卡刺激宿主產(chǎn)生免疫保護(hù)的機(jī)制，為研究具有我國(guó)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的疫苗提供了理論基礎(chǔ)和科學(xué)依據(jù)。

文章題目：Proteogenomic analysis and discovery of immune antigens in Mycobacterium vaccae.