自我所成立以來，所領導班子和全所員工在衛生部和院校的領導及兄弟單位的支持下，認真做好所址籌建以及承擔國家科研和應急處置等任務的能力建設兩項重要工作。一方面通過租用臨時空間，搭建技術平臺，凝聚專業人才，建設創新機制，逐步發展成為相關領域中的一支生力軍。另一方面，根據“明確定位、瞄準前沿、預留未來、做實做細”等原則做好所址建設的前期工作。經過不懈努力，于2008年底編制完成我所所址建設立項建議書。日前，國家發展改革委員會正式批準我所所址建設立項建議書，并將其列為國家重點工程建設項目。

我所新址項目建設地點位于北京市中關村科技園區大興生物醫藥產業基地。項目規劃用地近80畝，建筑面積超過4萬平方米，包括科研實驗樓、科技支撐樓、行政辦公樓、專家和研究生公寓樓等建筑。

我所所址建設已進入項目可行性研究報告編制階段。根據可行性研究報告編制的要求，著手落實概念設計、環境評估等工作，目前各項相關工作已經逐步展開。