綜合新聞
任仙文博士等在《Clinical Microbiology and Infection》雜志在線發表論文探討二代測序技術在甲型流感病毒檢測中的應用
甲型流感病毒對人類健康構成嚴重威脅。由于甲型流感病毒共有八個基因組片段,所以不同型別甲型流感的重配極大地提高了甲型流感病毒的多樣性,這不僅對人類的免疫系統提出了挑戰,同時也為檢測和鑒定甲型流感病毒基因組各片段的型別帶來了困難。目前臨床上對甲型流感病毒的快速檢測主要依賴PCR擴增技術,然而由于在理論上甲型流感病毒不同亞型片段重配方式可達上百種之多,實際檢測中PCR檢測技術不能全部覆蓋。當新型甲型流感如H7N9型和H10N8型禽流感感染人導致嚴重疾病甚至導致在人際傳播時,PCR檢測技術不能全面提供病毒基因組各片段的鑒定信息,從而也難以進一步對其傳播風險、毒力、耐藥性等給出評價。隨著高通量測序技術的不斷發展,特別是臺式(benchtop)測序儀的出現,為快速、通用、靈敏、準確地鑒定甲型流感并進行分型、各基因組片段的遺傳特征和風險評估提供了技術基礎。任仙文博士等在該項研究中基于真實的檢測數據,給出了臨床上應用Ion Torrent和Illumina MiSeq這兩種新型臺式測序儀檢測和鑒定甲型流感病毒的評價,研究發現這兩種測序儀不僅可以作為甲型流感的通用檢測設備,也可以作為準確的分型設備,而且可以為病毒溯源和毒力評價、耐藥評價等提供富有價值的參考信息,具有不可替代的臨床應用價值。