結核病是危害人類健康的主要傳染病之一，是當今世界上傳染病中的主要殺手，我國結核病疫情日趨嚴重，防控形勢非常嚴峻。目前用于預防結核病的卡介苗對成年人的肺結核幾乎沒有保護力，近年來全球正在研發疫苗，如結核減毒活疫苗、BCG重組疫苗、結核亞單位疫苗以及DNA疫苗等臨床試驗效果均不理想。目前，母牛分枝桿菌（Mycobacterium vaccae）疫苗是近90年來針對結核病僅有的一個進入III期臨床試驗的免疫治療性疫苗，其商品名稱為微卡。盡管其應用前景非常看好，但是關于此疫苗株的基因組、蛋白質組、免疫抗原組份等背景都不清楚。

金奇課題組的鄭建華副研究員等采用第二代深度測序（next-generation sequencing (NGS) technologies）結合第三代測序技術, 對微卡的全基因組序列進行了測定，同時利用凝膠電泳結合高分辨率、高精確性的傅里葉轉換質譜，對微卡的蛋白質組進行了系統、全面的分析，鑒定出3387個可信度極高的蛋白，其中581個基因組中編碼的“hypothetical proteins” 在蛋白水平得到了驗證。同時確認了445個蛋白的翻譯起始位點，更正了98個蛋白的起始位點。更有意思的是，首次發現了38個在基因組注釋中漏掉的“新”蛋白。結合蛋白質組和基因組測序結果，采用蛋白組基因組學方法，首次獲得微卡的基因組精細圖譜和準確的注釋。

隨后采用免疫蛋白質組學方法，利用活動性肺結核病人的血清樣本，初步篩選并鑒定出35個免疫抗原候選物，將其中的20個編碼基因進行克隆和表達，純化后的蛋白與100個結核病人的血清樣本進行體液免疫驗證，其中的8個能產生較強的陽性免疫反應。進一步進行細胞免疫分析后發現，其中的一個蛋白，MYVA_1927，也具有較強的細胞免疫活性。這是首次從體液免疫和細胞免疫水平鑒定出微卡的多個免疫原，有利于進一步深入地闡明微卡刺激宿主產生免疫保護的機制，為研究具有我國自主知識產權的疫苗提供了理論基礎和科學依據。

文章題目：Proteogenomic analysis and discovery of immune antigens in Mycobacterium vaccae.