研究表明，全球半個多世紀(jì)以來引起新發(fā)傳染病疫情的病原體超過80%來源于野生動物和媒介生物，且以病毒為主。這些病毒在自然宿主或媒介載體等疫源生物內(nèi)循環(huán)傳播，與其共進(jìn)化并頻繁變異獲得新的生物學(xué)屬性和感染特征，一旦突破物種屏障傳染給人類，往往會對人類健康造成巨大威脅。近年來，盡管全球科學(xué)家已經(jīng)開展了很多針對野生動物和媒介生物攜帶病毒的研究，但是由于大量的數(shù)據(jù)信息散布于各種文獻(xiàn)和序列數(shù)據(jù)庫中，難以進(jìn)行系統(tǒng)的歸納總結(jié)和進(jìn)一步的深度挖掘，使得我們對這些疫源生物攜帶病毒的總體狀況和變化特征缺乏全面系統(tǒng)的了解。

鼠類和蝙蝠是地球上種群最大的兩類哺乳動物，具有分布廣、種類多、種群大、并且與人類和家畜接觸密切等特點，已被證實是百余種人類病毒的天然宿主和儲存宿主，如漢坦病毒、拉沙熱病毒、尼帕病毒、埃博拉病毒和SARS冠狀病毒等。蚊和蜱是目前公認(rèn)最重要的媒介生物，它們攜帶的各種蟲媒病毒可以引起很多嚴(yán)重的人類傳染病，如登革熱、基孔肯雅熱、西尼羅腦炎、黃熱病和寨卡熱等。而且，一些動物源性病毒和蟲媒病毒可以在不同動物宿主和媒介生物之間交叉播散，進(jìn)一步增加了其跨種傳播的風(fēng)險。

近年來，金奇課題組一直致力于闡明關(guān)鍵野生動物及媒介生物攜帶的病毒組特征，建立完善的監(jiān)測、預(yù)警和溯源體系，從而實現(xiàn)新發(fā)傳染病防控的關(guān)口前移。通過近十年的持續(xù)努力，已經(jīng)初步揭示了我國全境范圍內(nèi)和東南亞地區(qū)代表性蝙蝠、鼠類和蚊等重要疫源生物的呼吸道和消化道病毒組特征，相關(guān)研究相繼發(fā)表于《ISME Journal》（2016）和《Microbiome》（2018、2021）等。同時，楊劍課題組通過對海量公共數(shù)據(jù)的系統(tǒng)挖掘，并輔以相關(guān)文獻(xiàn)信息的人工提取和核對校驗，先后自主設(shè)計開發(fā)了蝙蝠相關(guān)病毒數(shù)據(jù)庫DBatVir（Database, 2014）和鼠類相關(guān)病毒數(shù)據(jù)庫DRoVir（J Genet Genomics, 2017）。

在此基礎(chǔ)上，該團(tuán)隊通過進(jìn)一步收集構(gòu)建重要媒介生物蚊和蜱相關(guān)的哺乳動物病毒數(shù)據(jù)集，并設(shè)計開發(fā)全新的數(shù)據(jù)展示和整合分析系統(tǒng)，構(gòu)建了國際上首個重要疫源生物相關(guān)病毒數(shù)據(jù)資源平臺ZOVER（http://www.mgc.ac.cn/ZOVER）。該平臺目前共收集整理了2,100余篇文獻(xiàn)報道的近40,000個源自蝙蝠、鼠類、蚊和蜱相關(guān)樣本的哺乳動物病毒，涉及全球150多個國家的960多種疫源生物。該數(shù)據(jù)平臺不僅收集整理了病毒樣本的關(guān)鍵元信息（如取樣時間、地點、樣本類型、宿主種屬、病毒檢測方法等），還整合了相關(guān)疫源生物的分布區(qū)域、親緣關(guān)系等重要信息，并提供了友好易用的界面和多種在線數(shù)據(jù)分析工具（如基因組瀏覽、比對、進(jìn)化、統(tǒng)計等）。此外，ZOVER平臺還專門開發(fā)了病毒組在線比較分析功能，可以從時間和空間等不同角度對同類宿主之間（如中華菊頭蝠和中菊頭蝠）或不同類宿主之間（如蝙蝠和鼠類）的病毒組特征進(jìn)行可視化比較分析，從而為發(fā)現(xiàn)不同疫源生物的病毒組潛在變化規(guī)律提供線索。

該研究構(gòu)建了國際上首個綜合性疫源生物相關(guān)病毒數(shù)據(jù)資源中心和分析系統(tǒng)，為未來潛在的動物源性新發(fā)病毒性傳染病的預(yù)警、鑒定、檢測和溯源提供了整合的數(shù)據(jù)信息和綜合的分析平臺。近日，相關(guān)研究成果發(fā)表于《Nucleic Acids Research》雜志，中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所博士研究生周思宇和主管技師劉博博士為論文共同第一作者，楊劍研究員、吳志強研究員和陳立宏副研究員為論文共同通訊作者。該研究獲得了中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程項目資助（2020-I2M-2-001）。